多数医学专家认为，怀孕不会使甲亢病情恶化，因此，甲亢并非是妊娠的绝对禁忌症。但与非妊娠甲亢相比，甲亢孕妇在用药方面还是有所不同。
妊娠期甲亢用药首选丙基硫氧嘧啶，因为它是硫脲类药物中最少透过胎盘屏障的(仅为他巴唑、甲亢平的1/3)的药物，故对胎儿影响不大。另外，妊娠期甲亢的用药剂量宜适当减少，这是因为妇女在妊娠期基础代谢率本身就高，体现在基础心率及甲状腺激素水平较非妊娠正常人稍高一些，因此，宜选择最小有效剂量，使甲状腺功能维持在正常偏高水平，以免引起母子甲状腺功能减退，影响胎儿正常发育。还有，由于抗甲状腺药物可从乳汁分泌，影响婴儿甲状腺功能，故产后需继续服药治疗者不宜哺乳。